تفسیر المیزان فراتر از یک اثر تفسیری معمولی، یک مکتب فکری منسجم برای پاسخ به پرسشهای اعتقادی و شبهات مدرن است. علامه طباطبایی با احیای روش تفسیر قرآن به قرآن، مسیر تازهای را برای فهم مستقیم کلام وحی بدون نیاز به پیشفرضهای کلامی بیرونی گشود.